群马大学于2005年6月1日开设了群马大学重粒子线医学研究中心，以开发放射线生物学及临床研究为基础的重粒子线治疗的提高及所需的治疗技术为目标。并且，以推进重粒子线医学的全面研究为目的。

群马大学作为一所大学医院，一直致力于癌症治疗工作并发挥群马大学医院的特色，可提供重粒子线治疗、手术治疗、药物治疗等相结合的多学科综合治疗。

迄今为止，群马大学在日本放射线肿瘤学和核医学领域中也发挥着重要作用。全日本10%的放射线治疗认证医师大部分都是来自群马大学的放射线医学系。另外，群马大学与日本利用放射线的代表研究机构放射线医学综合研究所放医研 及日本原子能研究开发机构高崎量子应用研究所原研机构高崎也保持着密切的合作。

2006年4月，群马大学重粒子线医学中心与NIRS签订了《重粒子线治疗等放射线医学利用研究的全面合作协议》，群马大学重粒子线医学中心将在教育和研究方面进行合作与合作，以开发高度专业化的人力资源。群马大学重粒子线医学中心已经建立了系统。

2003年4月，群马大学重粒子线医学中心与高崎定量研究所建立了研究生院合作课程（生物功能分析课程），并一直致力于通过利用辐射和培训研究人员来促进医学生物学研究。通过与该合作课程的合作，群马大学重粒子线医学中心在2004财年提出并获得21世纪COE计划的批准，为创新学术领域的“具有加速器技术的医学和生物学研究”设施创建教育和研究基地。

在这里，群马大学重粒子线医学中心促进重粒子线细胞反应的基础生物学研究，以及用于微癌和微血管疾病（年龄相关性黄斑变性等）的高精度碳离子显微外科治疗技术的开发研究。

群马大学向放射线医学研究和放射疗法积累很多的医学部门和附属医院引进了重粒子线治疗设备，以实施先进的微创癌症治疗，以及群马大学重粒子线医学中心相信进行研发是一项极为重要的工作，2001年，群马大学重粒子医学中心被认可着手策划在大学内整备重离子线放射设施。该设施于2009年3月建成，治疗于2010年3月开始。